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Quels sont les 7 meilleurs logiciels de comptabilité pour auto-entrepreneur ?

5 min. de lecture
Mis à jour le 11 Mai 2023
Logiciel comptabilité auto-entrepreneur
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En résumé

  • Les obligations comptables de l’auto-entrepreneur étant limitées, s’équiper d’un logiciel de comptabilité n’est pas obligatoire. 

  • Un logiciel de comptabilité pour auto-entrepreneur permet de gagner du temps tout en respectant ses obligations légales et en protégeant ses données.

  • Pour bien choisir un logiciel de comptabilité, l’auto-entrepreneur doit avant tout connaître les besoins propres à son activité et au statut de la micro-entreprise.

Pourquoi utiliser un logiciel de comptabilité pour auto-entrepreneur ?

Même si, par définition, la comptabilité en micro-entreprise est simplifiée, elle fait partie intégrante du rôle de gérant de l’auto-entrepreneur. De plus, utiliser un outil comptable adapté présente 3 grands avantages :

1️⃣ Le respect des obligations légales en micro-entreprise

Déclaration de chiffre d’affaires, tenue de registre etc… Il existe des obligations fiscales et sociales propres au statut d’auto-entrepreneur qu’il est incontournable de respecter. Avec un bon logiciel de comptabilité vous avez la sérénité d’esprit de ne pas omettre ces obligations, et notamment en matière de facture ou de déclaration.

2️⃣ Le gain de temps

Généralement, on ne devient pas micro-entrepreneur pour le plaisir de faire de l’administratif ou de la comptabilité mais plutôt pour passer du temps au cœur de son activité. Un logiciel de comptabilité vous permettra de gagner du temps en comparaison d’une tenue de vos comptes sur Excel ou à la main. De plus, il vous assurera également un risque d’erreur limité surtout en cas de contrôle fiscal.

3️⃣ La protection des données de la micro-entreprise

Parce qu’ils se doivent de respecter des normes d’exigences en termes de protection et de confidentialité des données, les logiciels de comptabilité en ligne sont bien plus sécurisés qu’un simple stockage sur le disque dur de votre ordinateur.

Comment bien choisir son logiciel de comptabilité quand on est auto-entrepreneur ?

Nous avons fait cette sélection de 7 logiciels de comptabilité en fonction de critères qui correspondent aux spécificités du statut d’auto-entrepreneur. Il vous restera à apprécier celui qui correspond le plus à votre activité, votre situation et vos préférences. Mais pour vous aider dans ce choix, voici quelques critères à prendre en considération :

Les fonctionnalités nécessaires à un auto-entrepreneur

Certaines fonctionnalités sont indispensables à l’auto-entrepreneur en termes de comptabilité. Il s’agira notamment du registre des recettes et des dépenses. Mais d’autres fonctionnalités sont également pleines d’avantage pour une micro-entreprise, comme :

  • la synchronisation bancaire ;

  • la déclaration à l’URSSAF ;

  • la facturation ;

  • le tableau de bord pour le suivi du chiffre d'affaires

Sur ce dernier point, un logiciel comptable qui intègre les déductions du chiffre d’affaires ou le calcul des cotisations d’une micro-entreprise peut être aussi d’une aide très précieuse !

Les logiciels de comptabilité pour auto-entrepreneur

Il existe des logiciels spécialement dédiés aux micro-entreprises, comme Freebe ou TiimeAE, par exemple. Mais ils ont des fonctionnalités limitées au statut simplifié de l’auto-entreprise, il est donc important de bien identifier ce dont vous avez besoin avant de faire votre choix.

Ces logiciels de comptabilité pour auto-entrepreneur ont l’avantage d’une prise en main facilitée et de s’adapter à la gestion d’une micro-entreprise en appliquant les changements de seuils de TVA, par exemple.

Mais attention ! Si votre micro-entreprise est amenée à évoluer et donc à changer de statut, vous serez également obligés de changer de logiciel de comptabilité et donc de prendre le risque de perdre l’historique de votre gestion comptable.

Les tarifs des logiciels de comptabilité

Si le tarif d’un logiciel de comptabilité pour auto-entrepreneur est un critère important, il est aussi nécessaire d’en évaluer le coût mensuel ou annuel. Mais également, d’évaluer cet investissement en fonction :

  • du temps qu’il vous fait gagner ;

  • de son degré de performance ;

  • de la sérénité qu’il vous apporte d’être en conformité avec les obligations légales.

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité gratuit ?

Certes, la première recherche d’un auto-entrepreneur est généralement de savoir quel est le meilleur logiciel de comptabilité gratuit. Cependant, il est nécessaire de bien prendre en compte les limites de ce type d’outils et notamment :

  • une automatisation bien moindre donc plus de temps à y consacrer ;

  • moins complets impliquant l’utilisation d’autres outils en complément.

Alors, entre la gratuité et le prix que vous coûterait un expert-comptable : faites le comparatif ! Cela peut vous aider à trouver le juste prix de votre logiciel de comptabilité.

Sélection des 3 meilleurs logiciels gratuits

Conscient que le budget peut être un critère incontournable pour de nombreux auto-entrepreneurs voici 3 logiciels de comptabilité 100 % gratuits qui peuvent convenir à la gestion comptable d’une micro-entreprise :

  • TiimeAE permet de regrouper sous un seul outil la facturation et la comptabilité avec une utilisation intuitive et simplifiée ;

  • MyAE et ComptaAE ou MyAE sont aussi des logiciels de comptabilité gratuits dédiés au statut d’auto-entrepreneur ;

  • Odoo propose également une formule gratuite suffisante pour une micro-entreprise.

Meilleurs logiciels de comptabilité pour auto-entreprise : notre sélection

Le premier critère de notre sélection a été de nous diriger vers des logiciels de comptabilité SaaS, c’est-à-dire qu’ils s’utilisent directement en ligne. En effet, ils présentent généralement un rapport qualité/prix bien plus intéressant. Mais ils ont aussi l’avantage d’être itinérants et plus modernes que les logiciels à télécharger.

Abby : logiciel de comptabilité tout-en-un pour les auto-entrepreneurs

Récemment arrivé sur le marché, Abby est un logiciel de comptabilité pour les auto-entrepreneurs qui propose les 3 principales fonctionnalités indispensable aux auto-entrepreneurs :

  • un module devis et facturation ;

  • la synchronisation bancaire ;

  • les déclarations URSSAF en 1 clic.

Son seul point faible, c’est qu’il est exclusivement dédié à la gestion d’une micro-entreprise. Par conséquent, vous serez obligé de changer de logiciel si votre activité doit évoluer vers une autre forme juridique.

Avantages 👍

  • Logiciel tout-en-un (facturation, compta, pilotage…)

  • Synchronisation bancaire

  • Déclaration URSSAF en un clic

  • Tarif compétitif

  • Sans engagement

Inconvénients 👎

  • Uniquement pour les micro-entreprises

Freebe : le logiciel de comptabilité des Freelances

Freebe est un logiciel de comptabilité dont les fonctionnalités ont été conçues pour répondre précisément aux besoins spécifiques des freelances en micro-entreprise. Vous y bénéficierez de :

  • un registre des dépenses et des recettes à édition automatique ;

  • une synchronisation avec l’urssaf pour l’automatisation des déclarations ;

  • un module de facturation très complet.

  • la synchronisation bancaire ;

  • des tableaux de bord de suivi.

Son inconvénient principal c’est qu’il ne conviendra pas à toutes les professions et autres statuts que celui de freelance en micro-entreprise.

Avantages 👍

  • Logiciel devis & facturation très complet

  • Intégration avec votre banque

  • Comptabilité automatisée

  • Déclaration URSSAF à votre place

  • Démo privée sur demande

Inconvénients 👎

  • Uniquement pour les micro-entreprises

  • Personnalisation des factures limitée

Indy : le logiciel de compta pour les auto-entrepreneurs en profession libérale

Conçu spécialement pour les professions libérales, Indy est simple d’utilisation et possède les fonctions principales d’un logiciel de comptabilité pour auto-entrepreneur :

  • la synchronisation bancaire ;

  • l’automatisation ;

  • un tableau de bord de gestion intuitif.

Son point négatif peut se trouver dans son tarif, légèrement plus élevé que ses concurrents.

Avantages 👍

  • Synchronisation bancaire ;

  • Catégorisation comptable automatique ;

  • Pour les Auto-entrepreneurs, EI en BNC, Sociétés de service à l’IS ;

  • Version gratuite ou payante sans engagement ;

  • 100 % en ligne.

Inconvénients 👎

  • Support par mail uniquement dans la version gratuite ;

  • Tarif un peu plus élevé que ses concurrents.

Evoliz : un logiciel de facturation et de tenue comptable

Essentiellement axé sur la facturation, Evoliz possède cependant les fonctionnalités nécessaires pour la tenue comptable d’une auto-entreprise. On y retrouve notamment :

  • la synchronisation bancaire ;

  • le suivi de trésorerie ;

  • l’export de comptabilité.

On regrette cependant qu’il ne propose pas l’automatisation des déclarations URSSAF. Un point souvent essentiel pour les auto-entrepreneurs qui veulent gagner du temps !

Avantages 👍

  • Logiciel 100% français, personnalisable, collaboratif et évolutif ;

  • Outil complet de gestion ;

  • Processus automatisés.

Inconvénients 👎

  • Long à configurer ;

  • Pas déclaration de TVA automatique.

Sinao : un logiciel de comptabilité qui s’adapte à votre activité

Sinao est un logiciel de gestion complet, facile à prendre en main et adaptable en fonction de l’évolution éventuelle de votre statut. On y retrouve notamment :

  • La synchronisation bancaire ;

  • Un outil de facturation ;

  • L’import et l’export de comptabilité.

Dommage que son tarif mensuel soit un peu élevé, si on le compare à Freebe, par exemple, bien qu’il soit plus adaptable que ce dernier.

Avantages 👍

  • Logiciel de comptabilité complet et intuitif ;

  • Version gratuite non limitée ;

  • Synchronisation bancaire ;

  • 100 % en ligne.

Inconvénients 👎

  • Nombre factures limité dans chacune des offres (+10€ par mois au-delà) ;

  • Tarif un peu plus élevé que ses concurrents.

NeedMe : le logiciel de compta pour tous les auto-entrepreneurs

Doté de toutes les fonctionnalités nécessaires à la gestion d’une auto-entreprise, NeedMe a le grand avantage de s’adapter à toutes les professions avec, par exemple, un mode de facturation du client au temps. Il possède également :

  • Un registre des dépenses et des recettes ;

  • La synchronisation avec l’URSSAF pour l’automatisation des déclarations ;

  • Un module de facturation très complet.

On apprécie aussi tout particulièrement son tarif qui fait partie des plus bas du marché. Cependant, il lui manque encore aujourd’hui la synchronisation bancaire qui permet de gagner un temps considérable dans la gestion quotidienne d’une auto-entreprise.

Avantages 👍

  • Logiciel de gestion complet ;

  • Documents personnalisables ;

  • Suivi d’activité intuitif ;

  • Tarif attractif et sans engagement.

Inconvénients 👎

  • Pas de synchronisation bancaire

MaCompta.fr : une version comptable dédiée aux auto-entrepreneurs

Macompta.fr propose une version de son outil de comptabilité dédiée aux auto-entrepreneurs. Simple d’utilisation, complet et parmi les moins cher du marché, on comprend pourquoi ce logiciel est souvent cité comme la référence en termes de gestion comptable pour les auto-entrepreneurs ! outil adapté parmi les moins chers du marché. Très complet, il reste très simple à utiliser et sera facilement accessible par les plus novices.

Un point faible c’est qu’il n’existe pas en version mobile, ni de gestion des stocks.

Avantages 👍

  • Logiciel de comptabilité complet et intuitif ;

  • Synchronisation bancaire ;

  • Accepte tous les statuts ;

  • Assistance technique par téléphone incluse.

Inconvénients 👎

  • Pas de gestion de stocks ;

  • Pas d’application mobile.

De nombreux autres logiciels de comptabilité de bonne réputation pour les micro-entreprises existent sur le marché, comme JePilote, Gest4u ou encore mon-autoentreprise.fr, pour ne citer qu’eux.

Alors rappelez-vous que le meilleur logiciel de comptabilité pour votre auto-entreprise sera celui qui correspond à vos propres besoins !

Questions fréquentes

Article mis en ligne le 11 Mai 2023